Go Bust MIC

Go MICBUSTERS

Extracellulair RNA ‘bedraadt’ elektronenopname bij electromethanogenese – implicaties voor MIC

Extracellulair RNA ‘bedraadt’ elektronenopname bij electromethanogenese – implicaties voor MIC

Nieuwe bevindingen laten zien dat korte, extracellulaire RNA’s (eRNA) aan het oppervlak van Methanosarcina barkeri zich vouwen tot G-quadruplex (G4)-structuren die elektronen vanaf een kathode of ander vast substraat kunnen geleiden. Dit biedt een mechanistische verklaring voor directe elektronenopname zónder klassieke multiheme-cytochromen en plaatst methanogenen nadrukkelijker in het MIC-domein.

Wat is er precies gevonden?

  • eRNA-dominantie vroeg in groei: bij aanzet van de groei wordt een grote pool van extracellulaire nucleïnezuren uitgescheiden; ~80% daarvan is kort RNA.
  • G4-netwerk aan het celoppervlak: de korte RNA’s vormen G-quadruplex-architecturen die een geleidend netwerk op en rond de cel vormen.
  • Functioneel causaal bewijs: toevoeging van synthetisch G4-RNA verhoogt stroom-naar-methaan; afbraak van extracellulair nucleïnezuur met nuclease laat kathodische stroom en CH4 terugvallen, terwijl groei op oplosbare substraten (bijv. methanol) nauwelijks geraakt wordt.
  • Consistent met G4-chemie: hemin-afhankelijke peroxidase-activiteit en G4-specifieke signalen passen bij correct gevouwen G-quadruplexen.

Samen geven deze lijnen aan dat eRNA-G4 als ‘biologische bedrading’ kan fungeren voor extracellulaire elektronentransfer (EET) naar methanogenen.

Hoe past dit in bestaand onderzoek?

Al langer is bekend dat bepaalde methanogenen elektronen direct kunnen opnemen van een kathode en dat ze in consortia via DIET (Direct Interspecies Electron Transfer) elektronen ontvangen van o.a. Geobacter. Ook zijn er gevallen waarin methanogene extracellulaire enzymen (zoals hydrogenasen) de kathodische waterstofvorming katalyseren en zo de elektronenoverdracht versnellen. Het eRNA-G4 mechanisme biedt een alternatieve, eiwitvrije geleider aan het celoppervlak die deze observaties helpt verklaren—juist voor soorten zonder rijke cytochroom-machinerie.

  • DIET met methanogenen: elektronenoverdracht van Geobacter naar Methanosarcina is uitgebreid gedocumenteerd.
  • Kathodische elektronenopname door M. barkeri: meerdere studies bevestigen stroomgekoppelde methaanproductie bij aangelegde potentialen.
  • Rol van extracellulaire (hydrogenase)enzymen: dergelijke enzymen op staal/kathodes kunnen de overpotentiaal verlagen en stroom (en dus corrosie) verhogen.
  • G4-(DNA/RNA) en redox: G-quadruplexen kunnen met hemin peroxidase-achtige activiteit vertonen; de waargenomen G4-signalen zijn hiermee in lijn.

Relevantie voor MIC (biocorrosie)

In MIC-scenario’s is de kathode van de corrosiereactie vaak snelheidsbepalend. Als methanogenen via eRNA-G4 ‘bedrading’ elektronen effectiever opnemen, kan dat de kathodische stroomdichtheid verhogen. In galvanische termen betekent dit:

  • Vuistregel conversie: 1 µA/cm² komt voor ijzer overeen met ≈0,012 mm/jaar uniforme corrosie. Dus +5 µA/cm² extra kathodische stroom impliceert grofweg +0,06 mm/jaar aan uniforme corrosiesnelheid (alleen ter orde-grootte; lokale putcorrosie kan veel hoger uitvallen).
  • Empirische referentiepunten: in olieveldwachter wordt “corrosief” vaak gezien bij >0,15 mm/jaar terwijl “niet-corrosief” <0,08 mm/jaar oplevert; aanwezigheid van specifieke methanogene hydrogenase-genen (bijv. micH) correleert met de hogere klasse.
  • Mechanistisch kader: eRNA-G4 zou (naast enzymatische routes) een extra snelle elektronensnelweg kunnen vormen tussen Fe(0)/kathode en methanogene cellen—met potentieel hogere netto-stroom en dus hogere corrosiesnelheden waar methanogenen domineren.

Wat betekent dit voor de praktijk?

  1. Monitoring uitbreiden: naast klassieke SRB-markers ook methanogene signatuur (bijv. mcrA) en indicatoren voor EET/DIET meenemen. Overweeg elektrochemische set-ups (kathodes op –0,4 tot –0,6 V vs. Ag/AgCl) als proef in eigen matrix om stroom-respons te meten.
  2. Corrosierisico kwantificeren: koppel gemeten (kathodische) stroomdichtheden aan mm/jaar via Faraday en track drempelwaarden (bijv. equivalent >~13 µA/cm² ≈ >0,15 mm/jaar).
  3. Mitigatie richten: maatregelen die het eRNA-netwerk of G4-stabiliteit hinderen (indirect, via matrix/condities) kúnnen relevant zijn; in de praktijk blijft echter operational control leidend (potentiaal, nutriënten, spoelingen, inhibitoren).
  4. Bewijs opbouwen: documenteer parallel trends in qPCR-data, elektrochemie (E, I), gasproductie en metaalverlies (ER-sondes/coupons) om causaliteit aan te tonen.

Hoe MICBUSTERS helpt – qPCR veldtest en meerwaarde

Onze qPCR-veldtest op locatie levert binnen uren een kwantitatief profiel van methanogene gemeenschappen en relevante markers, gekoppeld aan uw bedrijfscondities.

Workflow

  1. Gestandaardiseerde monsterneming (water, slib, biofilm, coupons).
  2. Snelle DNA-extractie met inhibitie- en procescontroles.
  3. Doelwitten: mcrA, archaeale 16S rRNA; optioneel aanvullende markers (bijv. micH) en PMA-qPCR (levende fractie).
  4. Kwantificatie via standaardcurven; rapportage in genkopieën per mL of cm².
  5. Koppeling met potentiaal/stroom, gasdata en corrosiemetingen voor geïntegreerd advies.

Meerwaarde

  • Snelle besluitvorming: setpoints, doseringen en mitigatie in hetzelfde onderhoudsvenster.
  • Specifieke MIC-profielen: onderscheid tussen H2-mediatie, enzymatisch katalyseerde routes en potentiële eRNA-gedreven EET.
  • Trendbewaking & drempels: early-warning bij overschrijding van stroom-equivalenten (bijv. >~13 μA/cm²).
  • Proof-of-impact: aantoonbaar effect van maatregelen op zowel microbiologie als corrosiesnelheid.

Referenties (selectie)

This field is for validation purposes and should be left unchanged.
Privacy Overview
Logo

This website uses cookies so that we can provide you with the best user experience possible. Cookie information is stored in your browser and performs functions such as recognising you when you return to our website and helping our team to understand which sections of the website you find most interesting and useful. For more information visit our Privacy Policy page.

Necessary Cookies

Necessary Cookie required the page to work properly and save your preferences for cookie settings.

3rd Party Cookies

This website uses Google Analytics to collect anonymous information such as the number of visitors to the site, and the most popular pages.

Keeping this cookie enabled helps us to improve our website.